2013年6月16日上午，“南海I号”文物保护与研究合作签约仪式在广东海上丝绸之路博物馆三楼会议室举行。中国文化遗产研究院院长助理李战崎、广东海上丝绸之路博物馆馆长黄铁坚、中山大学人类学系主任麻国庆作为三家单位的代表，在广东省文物局副局长龙家有、阳江市宣传部长袁古洁及新闻媒体的见证下签署了三方协议书。

李战琦在发言中说，“南海I号”船体及其出水文物保护是国家“十二五规划”重点保护工程项目，同时又是一项系统、艰巨而且长期的保护工程项目，涉及到船体及木船构件、陶瓷、金属以及有机质等出水文物的现场保护、实验室保护、博物馆环境监控保护以及出水文物的科技考古等多方面的研究性课题，他希望三家单位发挥各自的优势特长，多学科交叉、形成合力，共同努力推动该项目的合作成功。

麻国庆希望各方在广东海上丝绸之路博物馆潜在的文物文化研究和外延的区域海洋文化之间，形成一种有效的对话机制，在接下来的合作与交流中，在理念探索与教学研究中有所突破。

黄铁坚表示，这次签约会议是广东海上丝绸之路博物馆推动“南海I号”研究保护的一次重要标志，博物馆会在各方面为平台的建设提供强有利的后勤保障。

根据协议规定，三方将在以下三个方面开展工作：在基地建设方面，将建立以“南海I号”为主要保护与研究对象、体现国家海洋战略需要的研究基地，主要包括中山大学博士后创新实践基地、中国广东海上丝绸之路文化研究基地和中国广东水下文化遗产科技保护基地；在科研方面，将开展“南海I号”船体及各类出水文物保护与保存研究，“南海I号”沉船及其出水文物相关的考古学与史学研究；在教学方面，将开展联合培养硕士、博士研究生，共同指导博士后的科研工作。学术会议方面，以创建学术品牌为目标，创立“南海I号”论坛。